黄巾之乱后，有功则尽皆封赏。
刘备因镇压起义军有功被封为安喜县尉，后来，朝廷有令：如因军功而成为官吏的人，都要被精选淘汰，该郡都邮要遣散刘备，刘备知道消息后，到督邮入住的驿站求见，督邮称疾不肯见刘备，刘备怀恨在心，将督邮捆绑督起来鞭打两百下后，与关羽、张飞弃官逃亡。
曹操受命与皇甫嵩等人合军进攻颍川的黄巾军，结果大破黄巾军，斩首数万级。随之迁为济南相。济南相任内，曹操治事如初。济南国有县十余个，各县长吏多依附贵势，贪赃枉法，无所顾忌。曹操之前历任国相皆置之不问。曹操到职，大力整饬，一下奏免十分之八的长吏，济南震动，贪官污吏纷纷逃窜。
孙坚把他的家眷都留在九江郡寿春县在淮、泗一带招募了一些士兵，加上跟随他在下邳县当差的同乡少年，共得精兵一千人。孙坚便率领这一千多士兵，随朱儁南征北战。朱儁把孙坚的事迹全部呈报给朝廷，朝廷任命孙坚为别部司马。
皇甫嵩战后以功拜左车骑将军、领冀州牧，封槐里侯。皇甫嵩到任后，上奏请求免冀州百姓一年的租税。后因得罪赵忠、张让而被罢免，改封都乡侯。
朱儁被皇甫嵩上表推功，进封西乡侯，迁任镇贼中郎将。又率军讨平南阳黄巾。
卢植黄巾起义时为北中郎将，率军与张角交战，后被诬陷下狱，皇甫嵩平定黄巾后力救卢植，于是复任为尚书。后因上谏激怒董卓被免官，隐居在上谷军都山。
黄巾虽止，然朝廷昏庸不休则民变不停。往后许多年里朝廷也都在极力镇压各方黄巾哗变。甚至于到188年汉灵帝不得已将军权转交给地方，已抵抗黄巾。而同年也再一次爆发了一次大规模的黄巾暴动。
至于敬威则已刘汉的身份得到了南阳太守这一职位。秦颉伏诛以后，其余下兵马还有八千余人可别看徐璆对敬威一脸和善却在临走前提走了五千人回荆州，而先前被俘的黄巾军也四散奔逃所留下的不过三千余人。所以留给敬威的不过仅有七千人，黄巾余部战力底下已经不用声明。而先前平贼乃是智取，并没有毁灭性的打击黄巾军。也就是说此时游荡在外的黄巾军尚有数万人，先前不来滋事无非是因为徐璆的大批官军还在。如今徐璆撤走了，便有不少黄巾余党在韩忠的组织下小规模试探性的对小县进行劫掠。这让敬威头痛不已，由于朱儁又将率军讨伐南阳黄巾的消息似乎被黄巾军所知。便有新降的黄巾军到敬威处求情道：“大人，我等黄巾本尽皆农耕只因生计难安方才行这般愚事。今城外黄巾兄弟大难将至，还望......
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